我科室创建于1949年建校初期，1984年硕士学位授权学科，1996年博士学位授权学科，基础医学博士后流动站组成学科。1999年底，学校进行学科优化组合调整，将基础部病理学教研室与附属长海医院病理科合并，归属长海医院，新组建的病理学教研室和我科集医、教、研为一体，解决了病理学科发展中普通存在的基础-临床分离的运转体制，更有利于培养医、教、研全面发展，高素质的病理学人才。学科现有工作面积1400余平方米，具有良好的工作环境和设备良好的常规病理、细胞病理、免疫病理、实验病理、分子病理、超微病理、组织细胞培养和图文分析等实验室。全科共有工作人员36名，其中主任医师、教授4名，副主任医师、副教授5名，高级实验2名。近5年先后6人次出国学习，其中4人学成回国。近5年培养博士研究生15名，硕士研究生14名，博士后1名。每年招收病理诊断和技术进修生5~7名。现任科主任朱明华教授，任全军和上海市病理学会副主任委员，上海抗癌协会肿瘤病理分会副主任委员，中华病理分会委员，上海市医学会和法医学会理事，癌症杂志副主编，中华病理杂志、诊断病理杂志、临床与实验病理学杂志等8种杂志编委。学科为全军病理专业委员会超微与分子病理专业组挂靠单位。长海医院每年临床病理2.3万余例，术中冰冻2千余例，细胞学9千余例，疑难病理会诊2千余例。常规开展免疫组织化学、组织化学、电镜、原位分子杂交、基因重排，肿瘤细胞药敏，液基薄层细胞等技术。同时开展科内读片会诊，上海市东北片9所医院临床病理读片交流等活动，不断提高病理诊断水平和学术交流。病理学教研室为上海市医疗纠纷尸检三个定点单位之一，每年尸检50余例，在全院每季度举行一次临床病理讨论会，及时总结经验教训，加强与临床联系和交流。

教学特色：承担全校各层次“病理学”和“法医学”课程，为全校研究生开设“肿瘤病理生物学”和“免疫组织化学”两门课程，医学本科生实行教案上网，全部教案实行多媒体系统。每年完成教学900余学时，通过学生近千人。具有种类齐全的大体标本库和良好的教学设备，2002年，病理学被列为校优秀教学课程，先后制作了“战、创伤病理学多媒体计算机辅助教学系统”、“临床病理讨论计算机辅助教学系统”和“病理学读片辅助教学”等多媒体教学教具，获校教学成果二、三等奖4项，3人获校“A”级教员，2个获上海市育才奖，1人获总后勤部育才银奖。自学科合併后，充分利用病理组织资源优势，建立了肿瘤组织库。肿瘤发病的分子病理机制和肿瘤侵袭转移分子病理机制，肿瘤病理诊断和鉴别诊断,癌前病变病理诊断标记物研究为学科重点，主要集中于肝癌、胰腺癌、胃肠道间质瘤、乳腺癌、肺癌、胶质瘤、骨肉瘤、淋巴瘤等领域。科研工作注重与临床相关科室结合和合作，增强临床应用价值。近年共获国家自然科学基金5项，军队科研基金1项，国家留学回国人员基金1项，2002年列为院学科建设“258”计划，资助建设经费200万元。近5年在国内外杂志发表论文150余篇，其中SCI收录12篇，主编出版专著4部，副主编和参编专著9部。合并后我科具有良好的工作环境，先进的实验室设备，更有一支团结奋斗，朝气蓬勃，开拓进取的学术队伍。合理的运转体系，密切的临床联系，保证了病理学科的有序发展，充分发挥和体现“病理学是医学之本”的重要地位和作用。